Por suerte a través de JAyatana ahora podemos integrar los menús de forma global con aplicaciones Swing en Unity.
Para ello basta con añadir la ppa:
sudo add-apt-repository ppa:danjaredg/jayatana sudo apt-get update sudo apt-get install jayatana
Una vez instalada cerramos la sesión y la iniciamos nuevamente para poder disfrutar del global menú en aplicaciones java.
Si queremos desinstalarlo, basta con ejecutar el siguiente comando:
sudo apt-get --purge remove jayatana libjayatana libjayatanaag libjayatana-java libjayatanaag-java